第1部分第2部分
仁斋直指方论
序卷之一诸中门中风中气中寒中暑中湿中恶厥卷之二诸伤门伤风寒伤暑伤湿伤酒伤食伤食泻卷之三诸气门七气痞塞积聚肿蛊胀香港脚阴气手气小肠气卷之四诸血门鼻衄舌衄肌衄牙宣吐血咯血嗽血小便血破伤血（见疮毒 扑证）大
叙一叙二卷一脉法辨男女脉法调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘难产横生胎衣不下产后寒热产后血晕产后中风宿血肿胀产后腹痛半产阴户脱恶血入心恶血入脾恶血入肺恶血入肝卷二胎前恶阻胎
简介赵叙正文
正文浮沉迟数滑涩人迎气口阳维阴维阳跷阴跷督任冲带附录运功规法南北规中引南旋式北旋式
增订医方歌诀
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
徐序鲍序卷上阳气阴气四气气相得则和不相得则病天符岁会六元正纪《灵》《素》不同《素问》传写之误《甲乙》之误王注之误心欲软肾欲坚三阳在头三阴在手脾气外绝劳风结阳结阴胃脘痈肠覃石瘕肺消四维相代四肢不举折髀水
序自序凡例卷之一调经门论经主冲任二脉论心脾为经血主统论脾胃生血论经不调由风邪客于胞中论三月一来为居经论师尼寡妇异乎妻外家之治论调经当抑气论调经先去病论调经大法论经水异色论经候愆期论月水多少论月水不利论