序原叙原例（次序略经更定）通行经络（补）人参高丽参黄精大枣面鹿肉羊肉鳝鱼淡菜人乳人气紫河车（和）甘草香附连翘合欢皮芜荑海桐皮乳香没药竹沥荆沥广皮枳子菠菜荠菜白豆酒灵砂百沸汤鹈鹕油蜂蜜（攻）大戟甘遂商陆
序卷一初诞法护养法噤风撮口脐风脉法变蒸肝脏心脏脾脏肺脏肾脏卷二面上症发搐目睛动唇口蠕动惊搐目直睡中惊动目动咬牙摇头便血偏风口噤角弓反张卷三急惊慢惊惊痫惊风天钓内钓盘肠气痛胎惊胎风五软五硬卷四风热风症痉
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
伤寒医鉴论脉证论六经传受论汗下论阳厥极深论湿热发黄论不得眠论呕吐论湿热下利论霍乱论好用寒药论小儿疮疹
茧唇一口疮二齿痛三舌症四喉痹诸症五喉痛六诸骨稻谷发鲠七治诸鲠咒法八误吞水蛭九诸虫入耳十蛇入七窍及虫咬伤十一男女体气十二附方并注
第一章 鼻部疾病第一节 外鼻畸形二、鞍鼻三、驼峰鼻第二节 先天性前、后鼻孔闭锁一、先天性后鼻孔闭锁二、先天性前鼻孔闭锁第三节 鼻及鼻窦外伤一、鼻骨骨折二、额窦骨折三、上颌窦骨折第四节 鼻前庭炎及鼻疖一
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
喉部论喉症喉症总论辨喉症经络治法喉科辨症双松症单松症双燕子症单燕子症双鹅症单鹅症双缠症单缠症悬蜞症合架症圹症瘰症乘枕症乘颚症斗底症HT症联珠症破头症掩头症大头症穿额症鱼鳞症玉笋症莲花症梅花症黑疔症抢食
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又
序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）