首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
人体解剖学歌诀内容运动系统运动系统歌诀全身骨歌诀各部椎骨特点歌诀胸骨歌诀颅骨歌诀鼻旁窦歌诀脊柱的韧带歌诀脊柱形态歌诀胸廓歌诀肩关节歌诀肘关节歌诀手腕骨歌诀膝关节歌诀跗骨歌诀颅底内面歌诀新生儿颅骨歌诀膈
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
第1部分第2部分
序祭神应王文岐伯阴阳脉例洁古老人内伤三阴例海藏老人内伤三阴例伤在少阴伤在太阳阴阳寒热各从类生服药同象伊芳尹汤液论例扁鹊仲景例仲景阴证论例易老法霍乱吐泻足阳明总摄六经霍乱与少阴寒热同候叔和阴脉例活人阴脉
序卷一脉诀辨惑论脉赋诊脉入式歌卷二心脏歌心脉见于三部歌心脉歌肝脏歌肝脉见于三部歌肝脉歌肾脏歌肾脉见于三部歌肾脉歌肺脏歌肺脉见于三部歌肺脉歌脾脏歌脾脉见于三部歌脾脉歌卷三七表八里脉总论七表脉交变略例论浮
原序潘序周序十药总论甲字十灰散乙字花蕊石散甲乙二方论丙字独参汤丙字人参汤论丁字保和汤戊字保真汤丁戊二汤方论己字太平丸己字太平丸论庚字沉香消化丸庚字消化丸论辛字润肺膏辛字润肺膏论壬字白凤膏癸字补髓丹平胃
六因条辨卷上春温辩论春温条辨三十条论伤暑中暑中热辨误伤暑条辨二十六条中暑条辨十一条中热条辨八条六因条辨卷中伏暑辨论伏暑条辨二十八条秋燥辨论秋燥条辨十一条冬温温毒条论冬温条辨十条温毒条辨四条六因条辨卷下
正文浮沉迟数滑涩人迎气口阳维阴维阳跷阴跷督任冲带附录运功规法南北规中引南旋式北旋式
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相