叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
风劳臌膈四大证治
序一序二序三凡例卷之一万金一统述药性歌诸病主药释形体周身脏腑形状人身面背手足之图（缺）十二经脉歌手太阴肺经脉歌∶手阳明大肠经脉歌∶足阳明胃经脉歌∶足太阴脾经脉歌∶手少阴心经脉歌∶手太阳小肠经脉歌∶足太
脉诀阐微
序题辞凡例总论第一延医法论第二表论第三里论第四寒论第五热论第六虚论第七实论第八辨惊风之误论第九不可饿论第十治痘论第十一治疹论第十二
呼吸系统疾病感冒支气管炎大叶性肺炎肺脓肿消化系统疾病慢性胃炎胃与十二指肠溃疡胃下垂膈肌痉挛胰腺炎细菌性痢疾乙型肝炎循环系统疾病心律失常动脉粥样硬化高血压和高血压性心脏病冠心病肺原性心脏病心功能不全泌尿
黄帝内经黃帝內經·素問(一)黃帝內經·素問(二)黃帝內經·靈樞(一)黃帝內經·靈樞(二)
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
自序卷之一痈疽门痈疽原委论第一痈疽治法总论第二痈疽阳症歌第三痈疽阴症歌第四痈疽半阴半阳症歌第五痈疽五善歌第六痈疽七恶歌第七治病则例歌第八痈疽灸法并禁灸疮穴第九论病生死法第十察形色顺逆第十一病有三因受病