自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
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序针经标幽赋流注通玄指要赋针经直说络说交经辨气血问答手足三阴三阳表里支干配合流注八穴序定八穴所在真言补泻手法夫妇配合古法流注杂忌法针灸避忌太一之图序冬至叶蛰宫说附∶针灸杂说窦汉卿流注指要后序
孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
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《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
述古斋医书叙叙二叙三叙四叙五凡例卷一·辨证觇神气审形色诊面察眼察耳察唇口察齿察鼻准验舌苔诊指纹察手足听声按胸腹询溲便候脉卷二·立法按法摩法掐法揉法推法运法搓法摇法汗法吐法下法针法灸法法砭法浴法法疏表法
赵序吴序卷一阴阳脏腑亢害承制卷二望色切脉辨证施治卷三二十六字符机理固润涩通塞清扬逆从求责缓峻探兼候夺寒热补泻提越应验卷四用药权衡炮制心法卷五古经解卷五古方解十全大补汤·八珍汤归脾汤补中益气汤四君子汤四
序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
自叙卷一·温病解第一温病名义附岐伯温义附仲景温义温病根原病原同异风寒异邪营卫殊伤传经大凡太阳经证头痛热渴阳明经证目痛鼻干少阳经证胁痛耳聋三阳传胃太阴经证腹满嗌干少阴经证干燥发渴厥阴经证烦满囊缩三阴入脏