序卷上辨阴证阳证辨脉辨寒热辨外感八风之邪辨手心手背辨口鼻辨气少气盛辨头痛辨筋骨四肢辨外伤不恶食辨渴与不渴辨劳役受病表虚不作表实治之辨证与中热颇相似卷中饮食劳倦论补中益气汤立方本指朱砂安神丸四时用药加减
序自序凡例卷之一调经门论经主冲任二脉论心脾为经血主统论脾胃生血论经不调由风邪客于胞中论三月一来为居经论师尼寡妇异乎妻外家之治论调经当抑气论调经先去病论调经大法论经水异色论经候愆期论月水多少论月水不利论
卷一针道源流针灸直指针灸方宜始论刺热论刺疟论刺咳论刺腰痛论奇病论刺要论刺齐论刺志论长刺节论皮部论经络论骨空论刺水热穴论调经论缪刺论经刺论巨刺论手足阴阳流注论卫气行论诊要经终论刺禁论刺法论五刺应五脏论：
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
序风温夹食时湿温暑风兼疹暑湿白红疹紫斑春温逆入心包伏暑伏暑内闭热入营分热入厥阴热邪消烁津液阴虚阳浮阴斑伏暑夹食霍乱夹食霍乱遗湿风斑寒水袭肺内燥冬温痰火暑风化疟阴疟肝胃瘅疟气虚下陷暑湿泄泻脾虚泄泻白积暑
序凡例运气流行法小儿病源总论辨实热辨虚热胎热预治方初生危证惊风之候丹毒之候腹痛之候杂证三关脉法观形察色法听声音法胎热急惊慢惊慢脾风天吊客忤中恶痉痫癫狂丹毒遍身胎肿瘰瘿瘤腹痛腹胀吐泻脱肛下疳疮痔疾治方大
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
提要看症口诀四季口诀大寒小寒七香跌打丸跌打总方回生丹跌打吊瘀煎水洗方
十问合阴阳天下至道谈胎产书杂禁方养生方却谷食气
简介自序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四